1511 год. Эцио Аудиторе да Фиренце мастер-ассассин отправляется на восток, на родину великого ассассина Альтаира ибн Ла-Ахада, где ищет следы утерянной библиотеки ордена Ассассинов. Прибыв в Масиаф, Эцио обнаруживает, что город находится под властью тамплиеров, которые желают получить находящийся там артефакт. Для доступа к артефакту необходимы пять печатей.