Сюжет разворачивается в хронологии между событиями Ace Combat 7 и Ace Combat 3. Игрокам предстоит стать безымянным пилотом, спасённым устаревшим авианосцем «Эндьюранс» после разгрома флота Осейской Федерации. Страна главного героя подверглась внезапному вторжению Республики Сотоа, и теперь ему предстоит вновь подняться в небо, чтобы вернуть утраченную родину.