Ассасин Дезмонд Майлс похищен корпорацией «Абстерго», принадлежащей тамплиерам. При помощи прибора «Анимус» он проживает жизнь своего далекого предка ассасина Альтаира ибн-Ла-Ахада. Действие разворачивается в древнем Иерусалиме, 1191 год.